První zmínka o vsi Krakovany pochází z roku 1244, kdy je vzpomínán Honata z Krakovan. V roce 1325 prodal Vesel z Krakovan ves i s dvorem Bedřichovi, opatu Sedleckého kláštera. V roce 1436 císař Zikmund daroval Krakovany spolu s dalšími obcemi v okolí Vaňkovi z Miletínka, který je trvale připojil k týneckému panství. S ním se v roce 1502 staly součástí pernštejnského pardubického panství a v roce 1560 součástí královského komorního zboží. Součástí Týnce nad Labem zůstaly Krakovany až do zrušení patrimoniální správy po roce 1848. V květnu roku 1944 část obce obsadily okupační německé oddíly za účelem zřízení střelnice v bývalé cihelně, radiolokační ústředny za vsí a polního letiště (to nebylo realizováno). Do 9. května 1945 zde pobývalo asi 300 německých vojáků.
V letech 1850 – 1960 patřily Krakovany jako samostatná obec do okresu Nový Bydžov, od roku 1961 připadla jako středisková obec spolu se sousedním Božcem do okresu Kolín.
Josef Vejvara (* 1. 12. 1869 Semily - † 14. 3. 1946 Hradec Králové) - prozaik a novinář, od roku 1886 působil v redakci Kolínských novin, později v Kolínských listech, v Krakovanech prožil většinu života.
Stanislav Vokál (* 8. 5. 1927 Krakovany) - učitel a novinář, v letech 1956-90 hlasatel Československého rozhlasu.
Název obce byl původně Krakované a je tedy odvozen od osobního jména Krak (Krakovan), což znamená Krakův/Krakovanův dvůr (statek).
Podvýborem pro heraldiku a vexilologii Poslanecké sněmovny Parlamentu České republiky byl dne 4. června 1998 usnesením č. 52 schválen znak a prapor obce. Autorem návrhu je heraldik Miroslav Pavlů. Jedná se tak zvaný „mluvící znak“, na kterém je v zeleném štítě zlatá liška ve skoku s červenou zbrojí a stříbrným kolčím helmem na hlavě (znak vladyky Honaty z Krakovan), která držící v pravé přední tlapě stříbrný lipový dvojlist na jednom stonku (zemědělský charakter obce). Vlajku tvoří tři svislé pruhy, bílý, zelený a bílý v poměru 1:3:1, v zeleném pruhu je žlutá liška ve skoku s červenou zbrojí a bílým kolčím helmem na hlavě.
Krakovany jsou dnes samostatnou obcí, jejichž součástí je obec Božec. Katastrální výměra činí 10,54 km² a žije zde 826 stálých obyvatel (1. ledna 2018).
Krakovany leží 13 kilometrů severovýchodně Kolína v nadmořské výšce 226 metrů.