Ves Chotouchov se poprvé připomíná v roce 1398, kdy byl v majetku Sázavského kláštera. V roce 1421 po zničení kláštera husity připadl Chotouchov nejprve Bedřichovi ze Strážnice, který ho připojil ke kolínskému panství, potom Václavovi Cardovi z Petrovic. Pak se vystřídalo několik zástavních držitelů, až v roce 1523 získal Chotouchov od krále Ludvíka Jagellonského do dědičného držení Jan Nyklásek ze Žitenic. V roce 1629 ho od Jindřicha Talacka z Ještětic koupil majitel Červených Peček Jan de Witte z Lilienthalu a když se v roce 1757 stává majitelem Jan Václav Vražda z Kunvaldu, připojil ho k Červenému Hrádku, Chotouchov si však přesto udržel charakter samostatného statku. V první třetině 19. století zakoupil Chotouchov hrabě Leopold Mořic ze Šternberka a připojil ho k zásmuckému panství, jehož součástí zůstal až do zrušení patrimoniální správy. Přestože se obec po tomto datu osamostatnila, chotouchovský statek zůstal v majetku Šternberků až do roku 1948, v roce 1992 jej restituovala dědička šternberského panství, Franziska Diana Sternbergová-Phipps.
Původ názvu obce je ze cstarého slovanského mužského jména Chotúch, tedy ves lidí Chotúchových.
Chotouchov je administrativní součástí obce Kořenice, jeho vlastní katastrální území činí 3,93 km².
Chotouchov leží v údolí Chotouchovského potoka 9 kilometrů jihozápadně od Kolína v nadmořské výšce 339 metrů.