Kdy byla obec založena není známo, první písemná zmínka pochází až z roku 1511, kdy Alžběta z Vlkanova, manželka Jana Hrabaně z Přerubenic, majitele červenopečeckého panství, odkázala část vsi v závěti svým poručníkům Bohuslavovi ze Suchotlesk a královskému písaři Zachovi. Později se ves vzpomíná v roce 1559 v majetku Jana Popela z Vesce, majitele suchdolského panství, které 6. září 1571 koupil Jiřík Voděradský z Hrušova a na Dobřeni, který je připojil k malešovskému panství. Ovšem již jeho vnučka Kateřina, provdaná za purkrabího Otu z Donína, je v roce 1631 prodala Jiljímu Fuksovi z Reynberka. Poté následovala řada majitelů, až ji v roce 1647 získal Jindřich Volf Berka z Dubé od Doroty z Vartenberka, který ji znovu připojil k Malešovu. S krátkou přestávkou v letech 1738–76, kdy patřili majiteli Suchdola Václavu Neumannovi z Puchholze, byly Bořetice součástí Malešova až do zrušení patrimoniální správy po roce 1848. V letech 1850 – 1950 byly Bořetice součástí okresu Kutná Hora, od roku 1950 jsou součástí okresu Kolín.
Původ názvu obce není zřejmý, může být odvozen od osobního jména majitele vsi (Bořita), lesu bor nebo od "zbořeného" hradiště.
Bořetice jsou od roku 1979 administrativní součástí městyse Červené Pečky, jejich vlastní katastrální území činí 1,98 km².
Bořetice leží na Vysockém potoce 7 kilometrů jihovýchodně od Kolína v nadmořské výšce 319 metrů.