Na místě dnešní vesnice stával již ve 13. století statek, na kterém se v roce 1354 vzpomínají Albrecht a Vojtěch ze Kbelu. Osudy tohoto statku souvisely vždy s dějinami sousedního Kbelu, takže byl také v roce 1634 vypálen Sasy. Když v roce 1661 koupil Kbel Hanuš Bedřich z Trauttmansdorfu, obnovil také Kbílek, kde vznikla hospoda, kovárna a 4 chalupy. Do roku 1843 se rozrostl počet chalup na 7 s 67 obyvateli.
Název obce je odvozen od sousedního (většího) Kbelu.
Kbílek je administrativní i katastrální součástí obce Kbel.
Kbílek leží 6 kilometrů jihozápadně od Kolína v nadmořské výšce 319 metrů.