Ves se poprvé připomíná v roce 1376, v roce 1412 byla již pustá. Zanikla zřejmě za Zikmundova vpádu do Čech v zimě 1402–03. Zpustlé pozemky zaniklé vsi koupilo město Kolín a na tomto místě nechalo vybudovat v roce 1494 velký rybník, zvaná Čakovec, později i Čekanec, které napájel náhon z říčky Klejnárky. V roce 1498 byl v sousedství vystavěn i druhý rybník, zvaný Sakman.
Katastr zaniklé vsi Čakovice náleží městu Kolín.
Ves Čakovice ležela na levém břehu Labe mezi Kolínem a Starým Kolínem, asi v místech dnešní pískovny Sandberk.