První dochovaná písemná zmínka o Močedníku pochází z listiny datované 23. května 1295, podle které se bratři Boleslav a Mikuláš z Močidlníka zúčastnili spolu s dalšími vladyky z regionu jako svědci vyměření nového újezdu při relokaci vesnice Bylany, kterou král Václav II. daroval ten den pražskému biskupství. Od roku 1547 patřila až do zrušení patrimoniální správy v roce 1845 k černokosteleckému panství. Počet obyvatel se v průběhu let snižuje, zatímco v roce 1890 zde žilo 110 obyvatel, v roce 2011 již jen pouze 24 obyvatel.
Název obce je odvozen z přídavného jména močidlný, kterým se označovalo mokré nebo bahnité místo, případně od slova močidlo neboli kaluž či louže. Kvůli snadnější výslovnosti vypadlo ze slova písmenko l a díky místnímu dialektu se ze samohlásky i stalo e. Označuje tedy polohu vsi na podmáčeném území. V minulosti se objevuje zápis názvu jako Mochidlnicz (1295), Moczidlnik (1388), Močidlník (1480, 1854) a nakonec Močedník (1893).
Močedník je katastrální součástí obce Chotýš, s kterou je administrativní součástí obce Vitice.
Močedník leží 7 kilometrů jižně od Českého Brodu (21 kilometrů západně od Kolína) v nadmořské výšce 300 metrů.